数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了NY230品系(flp-25(gk1016)回交二代)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验在含OP50食物的NGM低蛋白琼脂培养基中进行,记录了线虫的运动行为特征,包含原始视频处理数据、特征提取数据及标准化格式数据。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:flp-25 (gk1016)III on food R_2010_01_14__12_16_3676.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为实验的原始处理数据,可能记录线虫的运动轨迹、骨架结构等基础行为信息
- 特征数据文件
- 文件名称:flp-25 (gk1016)III on food R_2010_01_14__12_16_3676_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含从原始数据中提取的线虫行为特征数据,如运动速度、身体弯曲度等量化指标
- 标准化格式压缩文件
- 文件名称:flp-25 (gk1016)III on food R_2010_01_14__12_16_3676.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:包含符合wcon标准格式的线虫行为数据,便于跨平台共享与分析
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫神经生物学研究: 分析flp-25基因对秀丽隐杆线虫运动行为的调控机制
- 基因突变体行为表型分析: 比较突变体与野生型线虫的行为差异,探究基因功能
- 线虫行为量化方法验证: 基于tierpsy软件提取的特征数据,验证行为分析算法的有效性
- 神经肽信号通路研究: 以flp-25神经肽基因为模型,研究相关信号通路对行为的影响
- 模式生物行为数据库补充: 为秀丽隐杆线虫行为数据库提供标准化的实验数据支撑