数据集概述
本数据集属于秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库,记录了VC1063品系(携带nlp-15基因ok1512等位基因)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验在含OP50食物的NGM琼脂培养基中进行,使用tierpsy软件追踪分析,包含行为视频及处理后的特征数据,支持线虫基因功能与行为关联研究。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:nlp15 (ok1512) on food R_2009_06_09__11_30__5.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为追踪的原始数据,如骨架 segmentation 信息(共6410个分段骨架)、时间序列帧数据等基础行为记录
- 特征数据文件
- 文件名称:nlp15 (ok1512) on food R_2009_06_09__11_30__5_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含提取的线虫行为特征数据,基于tierpsy软件分析生成,关联基因与行为表型的量化指标
- 压缩数据文件
- 文件名称:nlp15 (ok1512) on food R_2009_06_09__11_30__5.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含wcon格式的行为数据压缩包,存储标准化的线虫行为记录
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析nlp-15基因对成年秀丽隐杆线虫行为表型的调控作用
- 模式生物行为学分析:基于骨架分段、运动特征数据,研究线虫在食物环境中的移动模式与习惯化行为
- 生物信息学工具验证:评估tierpsy软件在线虫行为追踪与特征提取中的应用效果
- 神经生物学机制探索:关联基因表达与行为表现,揭示线虫行为调控的分子神经机制