数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)RB2030菌株(nlp-3基因ok2688等位基因敲除)的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在特定培养条件下的运动行为,包含视频分析后的特征数据、骨架数据等,可用于研究nlp-3基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 文件名称:
nlp-3 (ok2688)X on food L_2009_06_05__16_11__23.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:可能包含线虫行为数据的标准化格式(wcon)压缩文件,记录行为轨迹等核心数据
- 文件名称:
nlp-3 (ok2688)X on food L_2009_06_05__16_11__23_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,可能包含运动速度、弯曲度等特征指标
- 文件名称:
nlp-3 (ok2688)X on food L_2009_06_05__16_11__23.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为实验的原始或处理后数据,如6269个分段骨架数据、视频帧相关参数等
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析nlp-3基因敲除对秀丽隐杆线虫运动行为的影响,探究该基因的生物学功能
- 行为学实验方法验证: 基于E. Yemini等人的实验方法,验证标准化线虫行为实验的可重复性
- 生物特征提取算法评估: 利用tierpsy软件生成的特征数据,评估线虫行为特征提取算法的性能
- 神经生物学机制研究: 通过线虫行为表型,反推nlp-3基因相关的神经调控机制