数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了VC282品系(pdl-1(gk157)II等位基因)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验于2011年8月25日在英国MRC分子生物学实验室完成,采用tierpsy软件追踪分析,包含线虫运动轨迹、骨架数据等核心内容,共3个相关文件。
文件详解
- 核心数据文件(HDF5格式)
- 文件名称:
pdl-1 (gk157)II on food R_2011_08_25__12_59_52___2___6.hdf5、pdl-1 (gk157)II on food R_2011_08_25__12_59_52___2___6_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为追踪的原始数据与特征数据,涉及26693个分段骨架数据、每秒30.03帧的视频解析信息、4.45771微米/像素的视频尺度参数等
- 压缩数据文件(ZIP格式)
- 文件名称:
pdl-1 (gk157)II on food R_2011_08_25__12_59_52___2___6.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为数据的WCON格式压缩文件,用于存储标准化的行为轨迹信息
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析pdl-1基因对秀丽隐杆线虫行为模式的影响
- 行为表型分析: 基于骨架数据与运动特征,研究线虫在食物环境中的运动轨迹、速度等行为表型
- 实验方法验证: 参考E. Yemini等的实验方法,验证线虫行为实验的标准化流程
- 生物信息学工具评估: 测试tierpsy软件在线虫行为追踪中的准确性与稳定性
- 神经生物学研究: 结合基因背景与行为数据,探究线虫神经调控机制