C_elegans_Behavioural_Database_秀丽隐杆线虫VC282品系行为实验记录数据

数据集概述

本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了VC282品系(pdl-1(gk157)II等位基因)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验于2011年8月25日在英国MRC分子生物学实验室完成,采用tierpsy软件追踪分析,包含线虫运动轨迹、骨架数据等核心内容,共3个相关文件。

文件详解

  • 核心数据文件(HDF5格式)
  • 文件名称:pdl-1 (gk157)II on food R_2011_08_25__12_59_52___2___6.hdf5pdl-1 (gk157)II on food R_2011_08_25__12_59_52___2___6_features.hdf5
  • 文件格式:HDF5
  • 字段映射介绍:包含线虫行为追踪的原始数据与特征数据,涉及26693个分段骨架数据、每秒30.03帧的视频解析信息、4.45771微米/像素的视频尺度参数等
  • 压缩数据文件(ZIP格式)
  • 文件名称:pdl-1 (gk157)II on food R_2011_08_25__12_59_52___2___6.wcon.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:包含线虫行为数据的WCON格式压缩文件,用于存储标准化的行为轨迹信息

数据来源

C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org

适用场景

  • 线虫基因功能研究: 分析pdl-1基因对秀丽隐杆线虫行为模式的影响
  • 行为表型分析: 基于骨架数据与运动特征,研究线虫在食物环境中的运动轨迹、速度等行为表型
  • 实验方法验证: 参考E. Yemini等的实验方法,验证线虫行为实验的标准化流程
  • 生物信息学工具评估: 测试tierpsy软件在线虫行为追踪中的准确性与稳定性
  • 神经生物学研究: 结合基因背景与行为数据,探究线虫神经调控机制
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 349.06 MiB
最后更新 2026年1月1日
创建于 2026年1月1日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。