数据集概述
本数据集属于秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了RB1802菌株(携带F54E4.4基因ok2336等位基因)的成年雌雄同体线虫在NGM低蛋白胨培养基上的行为实验数据。实验由英国MRC分子生物学实验室完成,包含视频记录的运动轨迹、骨架分割数据及特征提取结果,用于研究该基因敲除对线虫行为的影响。
文件详解
- 文件名称:
F54E4.4 (ok2330)X on food R_2011_08_09__11_28_43___1___4.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:可能包含线虫行为数据的标准格式文件(wcon),用于存储运动轨迹等原始或结构化行为数据
- 文件名称:
F54E4.4 (ok2330)X on food R_2011_08_09__11_28_43___1___4.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:科学数据存储格式文件,可能包含实验原始视频的处理中间数据或结构化运动参数
- 文件名称:
F54E4.4 (ok2330)X on food R_2011_08_09__11_28_43___1___4_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:特征提取结果文件,包含26288个分割骨架数据,记录线虫运动的特征参数(基于tierpsy软件提取)
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析F54E4.4基因敲除(ok2336等位基因)对线虫运动行为的影响
- 行为表型分析: 基于骨架分割和特征数据,研究线虫在食物环境中的运动模式、速度、轨迹等表型特征
- 神经生物学实验验证: 验证该基因在调控线虫行为中的作用机制
- 生物信息学特征挖掘: 利用提取的行为特征数据,构建线虫行为与基因功能的关联模型