数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了RB1802菌株(含F54E4.4基因ok2336等位突变)成虫在NGM低蛋白胨培养基上的行为实验数据。实验由剑桥MRC分子生物学实验室完成,采用tierpsy软件追踪分析,包含视频原始数据、行为特征数据及标准化格式文件,可用于研究该基因突变对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 行为特征数据文件
- 文件名称:F54E4.4 (ok2330)X on food L_2011_08_24__12_45_16__8_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为追踪的特征数据,基于tierpsy软件分析结果生成
- 原始追踪数据文件
- 文件名称:F54E4.4 (ok2330)X on food L_2011_08_24__12_45_16__8.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:记录线虫行为追踪的原始数据,包括26755个分段骨架数据等
- 标准化格式压缩文件
- 文件名称:F54E4.4 (ok2330)X on food L_2011_08_24__12_45_16__8.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含wcon格式的行为数据压缩包,用于数据标准化共享
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析F54E4.4基因ok2336突变对秀丽隐杆线虫行为的影响
- 行为学实验方法验证: 基于标准化实验流程(E. Yemini等方法)验证线虫行为追踪技术
- 模式生物行为分析: 利用高帧率(约每秒30帧)追踪数据研究秀丽隐杆线虫的运动模式
- 生物信息学工具应用: 测试和优化tierpsy等线虫行为追踪软件的性能与分析算法