数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了MT1540品系(携带egl-36(n728)X突变)成虫在含OP50食物的培养环境中的行为实验数据。包含实验条件参数、视频追踪数据及特征提取结果,用于研究该基因突变对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:egl-36 (n728)X on food R_2010_07_15__15_33_56612.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为原始追踪数据,包含时间序列的骨架分割信息等基础行为记录
- 特征数据文件
- 文件名称:egl-36 (n728)X on food R_2010_07_15__15_33_56612_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储提取的线虫行为特征数据,基于原始追踪数据计算得到的行为学指标
- 标准化数据压缩包
- 文件名称:egl-36 (n728)X on food R_2010_07_15__15_33_56612.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含wcon格式的标准化行为数据压缩文件,便于跨平台分析使用
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析egl-36基因突变对秀丽隐杆线虫行为模式的影响
- 生物行为学分析:基于视频追踪数据研究线虫的运动轨迹、速度等行为特征
- 基因与行为关联分析:探索离子通道基因(egl-36)对模式生物行为调控的分子机制
- 实验方法验证:参考Yemini等人的实验方法,复现或优化线虫行为学实验流程
- 行为特征提取算法测试:利用标准化数据验证行为特征提取软件的准确性与稳定性