数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了2010年3月30日开展的RB2005品系(T28F2.7基因ok2657突变体)成年雌雄同体线虫的行为实验数据,包含视频追踪原始数据、特征提取结果及标准化格式文件,用于研究线虫基因功能与行为表型的关联。
文件详解
- 核心数据文件(.hdf5格式)
- 文件名称:T28F2.7 (ok2657) on food R_2010_03_30__12_27_5444.hdf5、T28F2.7 (ok2657) on food R_2010_03_30__12_27_5444_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为视频的原始追踪数据、骨架分割结果(共19192个分割骨架)、行为特征提取结果(基于tierpsy软件分析)
- 标准化格式文件(.zip格式)
- 文件名称:T28F2.7 (ok2657) on food R_2010_03_30__12_27_5444.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含采用wcon标准化格式存储的线虫行为数据,便于跨平台共享与分析
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析T28F2.7基因ok2657突变对秀丽隐杆线虫行为表型的影响
- 模式生物行为学:基于视频追踪数据研究线虫在NGM低蛋白培养基、OP50食物条件下的运动模式
- 神经科学实验复现:参考实验方案(Yemini et al.方法)开展同类线虫行为实验
- 行为特征提取算法验证:利用tierpsy软件输出的特征数据,测试模式生物行为分析算法的有效性