数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了JC55菌株(携带flr-1(ut11)X基因突变)的成年雌雄同体线虫在NGM低蛋白胨培养基上的行为实验数据。实验于2010年3月31日开展,通过视频跟踪获取线虫运动特征,包含运动轨迹、骨架分割等量化信息,支持线虫基因功能与行为表型关联研究。
文件详解
- 特征数据文件:flr-1 (ut11) on food R_2010_03_31__11_55_0824_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,包含由tierpsy软件提取的运动特征、轨迹参数等量化指标
- 原始跟踪数据文件:flr-1 (ut11) on food R_2010_03_31__11_55_0824.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储视频跟踪原始数据,包含线虫骨架分割结果(共19806个分割骨架)、时间戳、像素与微米映射关系(4.1716微米/像素)等基础信息
- 行为数据压缩文件:flr-1 (ut11) on food R_2010_03_31__11_55_0824.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含wcon格式的线虫行为数据压缩包,可能涉及运动轨迹、姿态变化等标准化行为记录
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析flr-1(ut11)X基因突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响,探究基因与行为表型的关联
- 行为轨迹量化分析:基于视频跟踪数据,研究线虫在食物环境中的运动模式、速度变化及空间分布特征
- 基因行为学实验方法验证:参考实验方案(如30分钟适应期、视频拍摄参数),优化线虫行为学实验设计
- 模式生物行为数据库补充:作为秀丽隐杆线虫行为数据库的组成部分,支持大规模线虫行为数据整合与比较分析