数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)MT13113菌株(tdc-1(n3419)II)的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。实验记录了成年雌雄同体线虫在特定培养条件下的运动行为,包含视频追踪数据、特征提取结果等,可用于分析tdc-1基因突变对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 行为数据压缩文件
- 文件名称:tdc-1 (n3419) on food L_2010_03_12__14_43310.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为追踪的原始或标准化数据(wcon格式),记录线虫运动轨迹等行为信息。
- 主行为数据文件
- 文件名称:tdc-1 (n3419) on food L_2010_03_12__14_43310.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为追踪的核心数据,包含实验时长(898.527秒)、帧率(21.2314帧/秒)、像素分辨率(4.02599微米/像素)及15178个分割骨架数据等基础实验信息。
- 行为特征数据文件
- 文件名称:tdc-1 (n3419) on food L_2010_03_12__14_43310_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储经tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,用于量化分析线虫的运动模式等行为表型。
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析tdc-1基因突变体与野生型线虫的行为差异,探究tdc-1基因在调控线虫行为中的作用。
- 生物行为学实验方法验证: 基于标准化实验流程和tierpsy软件的追踪数据,验证线虫行为实验的可重复性与准确性。
- 神经生物学机制研究: 结合基因信息与行为数据,探索多巴胺合成相关基因(tdc-1)对神经系统功能及行为输出的影响。
- 模式生物行为表型分析: 利用特征数据量化线虫运动行为,建立基因突变体的行为表型数据库。