数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)LX982品系的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了特定基因型(ocr-1、ocr-2、ocr-4基因突变)成虫在NGM低蛋白胨培养基上的行为特征,包含视频跟踪数据、特征提取结果及标准化格式文件,可用于研究线虫基因功能与行为表型的关联。
文件详解
- 文件名称:
ocr-4 (vs137); ocr-2 (9447); ocr-1 (ok134) on food R_2010_07_06__12_27___3___8.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为实验的原始跟踪数据,可能记录线虫运动轨迹、姿态等基础行为信息
- 文件名称:
ocr-4 (vs137); ocr-2 (9447); ocr-1 (ok134) on food R_2010_07_06__12_27___3___8_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含提取的线虫行为特征数据,基于原始跟踪数据计算得到的运动、姿态等量化特征
- 文件名称:
ocr-4 (vs137); ocr-2 (9447); ocr-1 (ok134) on food R_2010_07_06__12_27___3___8.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(包含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:标准化的线虫行为数据交换格式文件,压缩包内包含符合wcon规范的行为数据记录
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析ocr-1、ocr-2、ocr-4基因突变对秀丽隐杆线虫行为表型的影响
- 模式生物行为学分析: 利用跟踪数据和特征数据研究线虫运动模式、环境响应等行为机制
- 行为实验标准化验证: 基于已知实验方案(E. Yemini et al.方法)验证行为实验的可重复性
- 生物信息学工具开发: 用于测试和优化线虫行为跟踪与特征提取软件(如tierpsy)的性能