数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了CB189 unc-32(e189)III品系成虫的行为实验数据。实验于2009年12月11日开展,使用NGM低蛋白胨琼脂培养基和OP50食物源,通过tierpsy软件追踪线虫行为,包含视频处理后的骨架分割、特征提取等数据,共3个文件。
文件详解
- 文件名称:
unc-32 (e189) on food R_2009_12_11__16_54_22___8___12.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:推测包含线虫行为追踪的原始或基础数据,如视频帧对应的线虫位置、姿态等信息
- 文件名称:
unc-32 (e189) on food R_2009_12_11__16_54_22___8___12_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:推测包含从行为数据中提取的特征信息,如运动速度、弯曲度、轨迹特征等
- 文件名称:
unc-32 (e189) on food R_2009_12_11__16_54_22___8___12.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包,推测包含符合WCON格式的线虫行为数据文件,用于标准化存储行为轨迹信息
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫遗传学研究: 分析unc-32基因对秀丽隐杆线虫行为表型的影响
- 神经发育机制研究: 探究III号染色体上unc-32(e189)等位基因相关的神经功能与行为调控机制
- 行为表型分析: 基于追踪数据研究线虫的运动模式、觅食行为等表型特征
- 实验方法验证: 参考E. Yemini等人的实验方法,验证线虫行为实验的标准化流程
- 生物信息学工具应用: 测试tierpsy软件在线虫行为特征提取中的性能与应用效果