数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了RB2188菌株(flp-20(ok2964)X突变体)成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂平板上的行为实验数据,包含视频追踪处理后的特征数据、运动坐标数据等,用于研究flp-20基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 行为特征数据文件
- 文件名称:flp-20 (ok2964)X on food R_2011_06_30__12_4038_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为特征数据,具体字段基于tierpsy软件分析结果,可能涵盖运动轨迹、身体姿态、行为模式等特征
- 核心行为数据文件
- 文件名称:flp-20 (ok2964)X on food R_2011_06_30__12_4038.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为实验的核心数据,可能包含原始追踪数据、骨架分割数据等基础信息
- 运动坐标压缩文件
- 文件名称:flp-20 (ok2964)X on food R_2011_06_30__12_4038.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储线虫运动坐标数据(wcon格式),可能包含时间序列的位置、姿态等运动相关坐标信息
数据来源
C.elegans behavioural database(movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析flp-20基因缺失对秀丽隐杆线虫行为模式的影响
- 神经生物学行为分析:探究线虫运动行为的特征参数与神经基因的关联
- 行为学实验方法验证:基于标准实验方案(Yemini et al.方法)验证线虫行为实验的可重复性
- 生物信息学数据挖掘:利用HDF5格式的行为特征数据开展线虫行为模式的大数据分析