数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)RB1990品系flp-7(ok2625)X突变体的行为实验数据,记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养基上的运动行为,包含视频分析生成的骨架数据、特征数据及元数据文件,是研究flp-7基因功能与线虫行为关联的基础数据。
文件详解
- 行为元数据文件:
- 文件名称:flp-7 (ok2625)X on food L_2010_01_11__11_55_3812.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含实验元数据,如线虫品系、基因信息、实验环境(培养基、食物、培养时间)、视频参数(帧率、像素分辨率)等
- 行为原始数据文件:
- 文件名称:flp-7 (ok2625)X on food L_2010_01_11__11_55_3812.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储视频分析生成的线虫分段骨架数据,共19282个骨架样本,记录线虫运动姿态的空间坐标信息
- 行为特征数据文件:
- 文件名称:flp-7 (ok2625)X on food L_2010_01_11__11_55_3812_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含基于骨架数据提取的线虫行为特征,如运动速度、弯曲度、身体姿态参数等
数据来源
MRC Laboratory of Molecular Biology William R Schafer实验室
适用场景
- 线虫遗传学研究:分析flp-7基因缺失对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 神经生物学实验:探究flp-7神经肽基因在调控线虫觅食、运动模式中的作用
- 行为表型分析:通过骨架数据和特征数据量化突变体线虫的行为表型差异
- 生物信息学算法验证:用于测试或优化线虫行为追踪算法(如tierpsy软件)的准确性和稳定性