数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫AQ908品系(携带mec-4基因突变及pmec-4::YC2.12转基因标记)的行为实验数据,记录了成年雌雄同体线虫在特定培养基上的运动行为特征,包含视频追踪原始数据、特征提取结果及标准化格式文件,是研究线虫机械感受基因功能与行为表型关联的基础数据。
文件详解
- mec-4 (u253) on food L_2010_09_30__11_43_2516.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为轨迹的标准化WCON格式压缩文件,记录线虫运动的时空坐标及相关行为参数
- mec-4 (u253) on food L_2010_09_30__11_43_2516_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:通过Tierpsy软件提取的线虫行为特征数据文件,包含运动速度、弯曲度、身体姿态等量化特征
- mec-4 (u253) on food L_2010_09_30__11_43_2516.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:线虫行为视频的原始追踪数据文件,包含26881个分段骨架数据,记录每秒30.03帧下的线虫形态与位置信息
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析mec-4基因突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响,探究机械感受基因的功能机制
- 行为学表型分析:基于标准化行为特征数据,开展线虫行为模式分类与表型量化研究
- 微观生物实验方法验证:参考实验方案(E. Yemini et al. 方法),验证线虫行为学实验的可重复性
- 生物信息学工具应用:测试Tierpsy等线虫行为追踪软件在基因突变体行为分析中的性能与准确性