数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了RB1380品系(基因型C11D2.2(ok1565)IV)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验在含OP50食物的NGM培养基上进行,经30分钟适应后记录,包含视频特征、行为轨迹等处理后数据,用于研究该基因敲除对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 文件名称:C11D2.2 (ok1565)IV on food R_2011_08_24__12_2438_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,可能包含运动轨迹、身体姿态、运动速度等关键行为指标
- 文件名称:C11D2.2 (ok1565)IV on food R_2011_08_24__12_2438.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:压缩包内为wcon格式的线虫行为数据,可能包含标准化的行为事件、时间序列等信息
- 文件名称:C11D2.2 (ok1565)IV on food R_2011_08_24__12_2438.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储实验原始或处理后的核心数据,可能包含视频帧对应的线虫骨架坐标(共计26685个分段骨架)、时间戳等基础信息
数据来源
MRC Laboratory of Molecular Biology(英国剑桥)William R Schafer实验室
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析C11D2.2基因敲除对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 行为表型分析: 基于骨架数据和运动特征,研究线虫的运动模式、速度、轨迹等表型
- 生物行为数据库补充: 作为秀丽隐杆线虫行为数据库的组成部分,支持大规模行为数据的整合分析
- 实验方法验证: 验证E. Yemini等人提出的线虫行为实验方法在基因功能研究中的应用效果