数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)RB1030 snf-9(ok957)IV品系的行为实验记录,包含实验条件参数、视频分析数据及特征文件,属于线虫行为数据库的一部分,可用于研究该基因敲除株系的行为表型。
文件详解
- 核心数据文件(.hdf5格式,共2个)
- 文件名称:snf-9 (ok957)IV on food L_2009_11_18__12_12_5526.hdf5、snf-9 (ok957)IV on food L_2009_11_18__12_12_5526_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:含线虫行为实验的原始记录与特征数据,包括骨架分割(19291个)、时间参数(总时长898.287秒,帧率25.641帧/秒)、空间参数(像素对应微米数4.67931)等
- 归档文件(.wcon.zip格式,1个)
- 文件名称:snf-9 (ok957)IV on food L_2009_11_18__12_12_5526.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为数据的归档文件,格式符合wcon标准
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析snf-9基因敲除对秀丽隐杆线虫行为表型的影响
- 分子生物学实验验证:验证E. Yemini等提出的实验方法在特定株系中的适用性
- 行为学数据分析方法优化:基于tierpsy软件生成的特征数据,优化线虫行为特征提取算法
- 实验室动物行为标准化研究:参考实验条件(如NGM培养基、OP50食物)建立线虫行为实验的标准化流程