数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录OH313菌株(ser-2(pk1357)X)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。包含实验条件、视频采集参数及分析生成的行为特征文件,可用于研究ser-2基因对线虫行为的影响。
文件详解
- 文件1:
ser-2 (pk1357) on food R_2009_12_15__14_45_58___8___10.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为轨迹数据的压缩文件,遵循WCON(Worm Behavior Consortium)格式标准
- 文件2:
ser-2 (pk1357) on food R_2009_12_15__14_45_58___8___10_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据
- 文件3:
ser-2 (pk1357) on food R_2009_12_15__14_45_58___8___10.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为原始分析数据,如骨架分割结果(共19652个分割骨架)、时间序列轨迹等
数据来源
William R Schafer实验室(MRC Laboratory of Molecular Biology)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析ser-2基因(pk1357等位基因)对秀丽隐杆线虫行为特征的影响
- 行为学实验方法验证: 基于E. Yemini等人的实验方法,验证线虫行为分析的标准化流程
- 行为特征提取算法评估: 对比tierpsy软件提取的行为特征与其他分析工具的差异
- 线虫行为数据库补充: 作为C.elegans behavioural database的组成部分,支持大规模线虫行为数据整合研究