数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了MT2293品系(egl-49(n1107)X基因突变)成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养基中的行为实验数据,包含视频追踪原始数据、特征提取结果及标准化格式文件,可用于研究该基因突变对线虫行为的影响。
文件详解
- 文件1:
egl-49 (n1107) on food L_2010_05_11__11_25_35___8___2.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:线虫行为视频追踪的原始数据文件,包含视频帧、骨架分割信息等基础数据
- 文件2:
egl-49 (n1107) on food L_2010_05_11__11_25_35___8___2_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:行为特征提取结果文件,包含线虫运动轨迹、速度、身体姿态等特征数据
- 文件3:
egl-49 (n1107) on food L_2010_05_11__11_25_35___8___2.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:标准化行为数据归档文件,采用wcon格式存储线虫行为的时间序列数据
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析egl-49基因突变对秀丽隐杆线虫运动行为、摄食行为等的影响
- 神经生物学实验验证: 验证神经递质相关基因(egl-49编码乙酰胆碱受体)对线虫行为调控的分子机制
- 行为学实验方法优化: 参考tierpsy软件的视频追踪方案,优化线虫行为实验的数据分析流程
- 模式生物数据库补充: 为秀丽隐杆线虫行为数据库提供标准化的基因突变体行为数据样本