数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了AQ2153品系npr-13(tm1504)V突变体成虫的行为实验数据。实验在含OP50食物的NGM低蛋白胨琼脂培养基中进行,通过视频追踪分析线虫行为特征,包含原始追踪、特征提取及标准化格式的三类文件。
文件详解
- 核心数据文件(共3个)
- 文件名称:npr-13 (tm1504)V on food R_2010_12_16__17_37_40__10.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:线虫行为原始追踪数据文件,包含视频帧、骨架分割等基础实验数据
- 文件名称:npr-13 (tm1504)V on food R_2010_12_16__17_37_40__10_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:行为特征提取文件,包含线虫运动轨迹、速度、体态等分析特征数据
- 文件名称:npr-13 (tm1504)V on food R_2010_12_16__17_37_40__10.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:标准化行为数据压缩包,采用wcon格式存储线虫行为的标准化记录
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析npr-13基因对秀丽隐杆线虫行为模式的调控作用
- 神经生物学实验验证: 验证npr-13突变体在食物环境中的行为响应特征
- 生物行为分析算法开发: 基于标准化行为数据优化线虫行为追踪与特征提取算法
- 模式生物数据库补充: 作为C.elegans行为数据库的组成部分,支持线虫行为组学研究
- 基因-行为关联分析: 探究npr-13基因与线虫运动、觅食等行为表型的关联机制