数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了NL334品系(gpa-2(pk16)V突变体)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验在含OP50食物的NGM琼脂培养基上进行,使用tierpsy软件追踪分析线虫运动行为,包含原始追踪数据、特征数据等文件,可用于研究gpa-2基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:gpa-2 (pk16)V on food L_2010_02_26__10_25_27__6.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为追踪的原始数据,如骨架分段信息、运动坐标等基础观测数据
- 特征数据文件
- 文件名称:gpa-2 (pk16)V on food L_2010_02_26__10_25_27__6_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为分析的特征数据,基于tierpsy软件提取的运动特征参数
- 压缩数据文件
- 文件名称:gpa-2 (pk16)V on food L_2010_02_26__10_25_27__6.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含wcon格式的线虫行为数据压缩包,可用于行为数据的标准化解析与复用
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析gpa-2基因对秀丽隐杆线虫运动行为的调控作用
- 生物行为学实验验证: 复现和验证线虫行为实验方法及结果,支持相关研究的可重复性分析
- 模式生物行为特征分析: 基于标准化行为数据,探究线虫在特定环境下的行为模式与特征
- 行为追踪软件应用验证: 测试和验证tierpsy等线虫行为追踪软件的数据分析效果与准确性