数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫NL1146品系(gpa-6(pk480)X突变体)的行为实验数据,来自C.elegans行为数据库。记录了线虫在NGM低蛋白胨培养基、OP50食物条件下的行为观测结果,包含视频追踪数据及特征提取结果,用于研究该基因突变体的行为表型。
文件详解
- 文件名称:
gpa-6 (ph480)X on food L_2010_02_25__11_44_09___4___7.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为追踪的原始数据,可能涉及视频帧、位置坐标等基础观测信息
- 文件名称:
gpa-6 (ph480)X on food L_2010_02_25__11_44_09___4___7_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含提取的线虫行为特征数据,基于tierpsy软件分析得到,涉及运动轨迹、身体形态等特征参数
- 文件名称:
gpa-6 (ph480)X on food L_2010_02_25__11_44_09___4___7.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含wcon格式文件,可能为线虫行为数据的标准化交换格式文件
数据来源
C.elegans behavioural database
适用场景
- 线虫遗传学研究: 分析gpa-6基因对秀丽隐杆线虫行为表型的影响
- 生物行为学分析: 研究线虫在特定培养基和食物条件下的运动模式、觅食行为等
- 实验方法验证: 基于E. Yemini等人的实验方法,验证线虫行为实验的可重复性
- 生物信息学工具应用: 测试和优化tierpsy等线虫行为追踪软件的特征提取算法