数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了DR1品系unc-101(m1)I基因突变型成虫的行为实验数据。实验于2010年4月15日开展,采用NGM低蛋白胨琼脂培养基和OP50食物源,通过tierpsy软件采集并分析线虫行为,包含原始视频处理数据、特征数据及标准化格式数据。
文件详解
- 行为数据文件(主数据)
- 文件名称:unc-101 (m1)I on food L_2010_04_15__12_28_1968.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为实验的原始处理数据,记录实验时长、帧率、像素微米比等基础参数,以及16539个分割骨架的行为轨迹信息
- 特征数据文件(分析数据)
- 文件名称:unc-101 (m1)I on food L_2010_04_15__12_28_1968_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征提取结果,涵盖基于骨架数据计算的运动、形态等行为特征指标
- 标准化格式文件(归档数据)
- 文件名称:unc-101 (m1)I on food L_2010_04_15__12_28_1968.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:以标准化wcon格式归档的线虫行为数据,便于跨平台共享与分析
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫行为遗传学研究: 分析unc-101基因突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 神经生物学实验验证: 结合基因与染色体信息,探究神经相关基因功能与行为表型的关联
- 行为分析算法优化: 基于标注的行为特征数据,测试或改进线虫行为识别算法
- 模式生物实验标准化: 参考实验方案与数据格式,建立统一的秀丽隐杆线虫行为实验规范
- 发育生物学研究: 分析成虫阶段线虫在特定食物源与培养条件下的行为模式