数据集概述
本数据集包含西澳极危兰科植物Caladenia huegelii栖息地土壤样本中的真菌多样性数据及环境元数据,用于支持菌根动态与环境监测整合的保护研究。数据涵盖真菌ITS序列、zOTU丰度表、分类信息及样本环境变量,共4个文件。
文件详解
- elib306_elib368_Jacopo_ITS_zotus.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:包含土壤样本中检测到的真菌ITS序列,每个序列头部含唯一zOTU标识符,对应丰度表,代表Caladenia huegelii栖息地的真菌多样性
- curated_zotuTable 1.tab
- 文件格式:Tab分隔文本
- 字段映射介绍:包含所有土壤样本中真菌zOTU的原始丰度计数,行代表zOTU,列代表样本,单元格为序列读数;包含每个zOTU的分类学信息(界、门、纲、目、科、属、种)
- C_huegelii_zOTU_table.xlsx
- 文件格式:Excel
- 字段映射介绍:包含Caladenia huegelii栖息地土壤样本中真菌OTU的读数,含分类学分类和样本丰度数据
- Metadata.xlsx
- 文件格式:Excel
- 字段映射介绍:包含样本元数据和环境变量,含样本标识符、采集日期和区域
数据来源
Dataset for: Integrating Mycorrhizal Dynamics and Environmental Monitoring for the Conservation of a Critically Endangered Orchid from Western Australia
适用场景
- 濒危兰科植物保护研究: 分析Caladenia huegelii栖息地的真菌多样性及其与植物生存的关联
- 菌根动态监测: 研究真菌zOTU丰度变化与环境因素的关系,支持菌根共生系统保护
- 土壤微生物多样性分析: 利用ITS序列和分类数据,探究栖息地土壤真菌群落结构
- 环境变量关联研究: 结合元数据中的环境信息,分析环境因素对真菌多样性的影响
- 生物多样性保护策略制定: 为极危兰科植物的栖息地保护和恢复提供数据支持