数据集概述
本数据集围绕分子定年分析中的校准不确定性展开，对比先验评估与后验评估方法的差异，探讨化石证据解释对贝叶斯分歧时间估计的影响。包含8个文件，涉及序列数据、树文件、控制文件及XML配置文件，用于支持分子钟校准质量评估研究。
文件详解
- 序列数据文件
- 文件名称：CytB+RAG1+R35-inc-outgroups.nex、CytB+RAG1+R35.nex
- 文件格式：.nex
- 字段映射介绍：包含分子序列数据，用于分子定年分析的序列输入
- 控制文件
- 文件名称：mcmctree.usedata2.ctl、mcmctree.usedata1.ctl
- 文件格式：.ctl
- 字段映射介绍：mcmctree分析的控制参数文件，定义数据使用方式等分析设置
- 树文件
- 文件名称：mcmctree._tree_file._uniform_priors.txt、mcmctree._tree_file._minimum_bounds.txt
- 文件格式：.txt
- 字段映射介绍：包含带校准先验的树结构信息，如统一先验、最小边界等时间约束
- 其他文件
- 文件名称：mcmctree._sequence_file.txt、BEAST.xml
- 文件格式：.txt、.xml
- 字段映射介绍：序列文件文本记录及BEAST分析的XML配置文件
数据来源
论文“Calibration uncertainty in molecular dating analyses: there is no substitute for the prior evaluation of time priors”
适用场景
- 分子定年校准方法研究: 对比先验与后验校准评估方法的有效性
- 贝叶斯分歧时间估计分析: 探讨化石证据解释对时间估计结果的影响
- 分子钟校准先验设置优化: 研究不同时间先验设置对分析结果的敏感性
- 系统发育分析方法评估: 评估校准一致性方法在分子进化研究中的应用局限
