数据集概述
本数据集对应Callaway et al. (2025)的研究,包含外来入侵植物在原产地与入侵地的生产力(ANPP、植被覆盖)和氮含量(铵态氮、硝态氮)数据,以及相关分析代码。数据覆盖野外调查和共同园实验两类场景,包含原始数据、预处理脚本、可视化代码及效应量(LRR)计算示例,支持研究外来入侵植物的生态影响机制。
文件详解
- 数据文件
- 文件名称:field_plants.xlsx/csv、field_nitrogen.xlsx/csv、common_garden_plants.xlsx/csv、common_garden_nitrogen.xlsx/csv
- 文件格式:XLSX、CSV
- 字段映射介绍:包含物种(species/Species)、地点(Location)、样方(Plot)、分布范围(Range/Home)、生产力指标(ANPP)、氮含量(ammon_ppm/NH4_ppm、nitrate_ppm/NO3_ppm)及效应量(LRR_NH4、LRR_NO3_ppm)等字段;Excel文件含"Metadata"工作表说明变量,"Data"工作表存储数据。
- 分析代码文件
- 文件名称:field_plants.R、field_nitrogen.R、common_garden_plants.R、common_garden_nitrogen.R
- 文件格式:R
- 字段映射介绍:对应四类数据的分析脚本,支持数据处理与统计分析。
- 可视化代码文件
- 文件名称:my_graphs.R
- 文件格式:R
- 字段映射介绍:生成箱线图-小提琴图的可视化脚本。
- 效应量计算示例文件
- 文件名称:create_LRRs_example_field_biomass.R
- 文件格式:R
- 字段映射介绍:以野外生物量为例的对数响应比(LRR)计算脚本,可验证效应量计算逻辑。
- 说明文件
- 文件名称:readme.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:数据集结构与使用说明。
数据来源
论文“Exotic invasive plant species increase primary productivity, but not in their native ranges”(Callaway et al., 2025)
适用场景
- 入侵生态学研究:分析外来植物在原产地与入侵地的生产力差异及驱动机制。
- 生态化学计量分析:探究入侵植物对氮素资源的利用策略及其与生产力的关系。
- 效应量验证:利用LRR计算脚本复现或验证入侵植物的生态影响效应量。
- 植物生态学实验设计:参考野外调查与共同园实验的数据结构,设计类似入侵植物研究。
- 数据可视化案例:基于my_graphs.R脚本学习生态数据的箱线图-小提琴图可视化方法。