Campylobacter_jejuni_Based空肠弯曲杆菌复发性感染耐药基因组组装数据集

数据集概述

本数据集包含临床复发性空肠弯曲杆菌感染病例中首次分离菌株（A1、B1）的基因组组装序列及注释信息，记录了菌株对大环内酯类和碳青霉烯类抗生素的体内耐药选择情况。数据支持微生物耐药机制研究与基因组特征分析。

文件详解

• 文件名称：Cje_metadata.xlsx
• 文件格式：XLSX
• 字段映射介绍：包含各菌株的基因组组装统计信息，包括欧洲核苷酸档案（ENA）登录号、基因分型数据及抗生素耐药谱。
• 文件名称：Assemblies.zip
• 文件格式：ZIP（压缩包）
• 内容说明：压缩包内包含元数据文件中各菌株的基因组组装文件，格式为.fasta（序列文件）和.gbk（GenBank注释文件）。

数据来源

ENA（欧洲核苷酸档案），研究登录号PRJEB42628、PRJNA505131

适用场景

• 微生物耐药机制研究：分析空肠弯曲杆菌对大环内酯类、碳青霉烯类抗生素的耐药基因特征与进化规律。
• 临床感染基因组分析：通过菌株基因组组装数据，研究复发性感染的菌株遗传关联性。
• 抗生素耐药谱验证：结合元数据中的耐药谱，验证基因组特征与表型耐药性的对应关系。
• 微生物基因组注释参考：为同类细菌基因组的组装、注释流程提供方法学参考。