数据集概述
本数据集聚焦草原鸣禽( Grasshopper Sparrow)的领地聚集现象,通过实验与观测方法检验社会互动(如群体防御、合作育雏、额外配对交配等)是否为领地聚集的驱动因素。包含基因分型、巢成功率、相关度分析等多维度数据,为动物分布生态学研究提供实证支持。
文件详解
该数据集包含31个文件,主要为CSV格式数据文件及1个HTML代码文件,具体说明如下:
- 基因相关数据文件:
- Genotypes.csv: CSV格式,包含鸣禽个体基因分型数据,字段包括ID、血样编号、基因座、等位基因、基因型质量等。
- metadata_Genotypes.csv: CSV格式,基因分型数据的元数据文件。
- SPAGEDI_output_distances_and_relatedness.csv: CSV格式,鸣禽个体间遗传距离与亲缘关系分析结果,包含Loiselle、Ritland等多种相关度计算方法的输出。
- metadata_SPAGEDI_output_distances_and_relatedness.csv: CSV格式,遗传距离分析结果的元数据文件。
- 领地密度与聚集数据文件:
- metadata_density_all_males_noNulls.csv: CSV格式,所有雄性鸣禽领地密度数据(无空值)。
- metadata_density_cuckolded_only.csv: CSV格式,仅包含被戴绿帽雄性鸣禽的领地密度数据。
- metadata_density_related_only.csv: CSV格式,仅包含有亲缘关系雄性鸣禽的领地密度数据。
- metadata_density_genetic_father_relatedness.csv: CSV格式,遗传父亲相关度与领地密度关联数据。
- metadata_density_aggregated_only.csv: CSV格式,仅包含聚集区域雄性鸣禽的领地密度数据。
- metadata_density_allmales.csv: CSV格式,所有雄性鸣禽领地密度数据。
- density_related_only.csv: CSV格式,仅包含有亲缘关系雄性鸣禽的领地密度数据。
- 巢与繁殖数据文件:
- metadata_nests_withEPP.csv: CSV格式,包含额外配对亲子关系(EPP)的鸟巢数据。
- metadata_nests_predation_and_parasitism.csv: CSV格式,鸟巢捕食与寄生情况数据。
- metadata_EPP_results.csv: CSV格式,额外配对亲子关系分析结果数据。
- metadata_EPP_relatedness.csv: CSV格式,额外配对亲子关系与亲缘度关联数据。
- metadata_nest_success_model.csv: CSV格式,巢成功率模型数据。
- nests_withEPP.csv: CSV格式,包含额外配对亲子关系的鸟巢数据。
- nests_predation_and_parasitism.csv: CSV格式,鸟巢捕食与寄生情况数据。
- nest_success_model.csv: CSV格式,巢成功率模型数据。
- EPP_relatedness.csv: CSV格式,额外配对亲子关系与亲缘度关联数据。
- 实验与其他数据文件:
- metadata_cooperative_defense_trials.csv: CSV格式,合作防御实验数据。
- metadata_BloodNumbers.csv: CSV格式,血样编号元数据。
- cooperative_defense_trials.csv: CSV格式,合作防御实验数据。
- 代码文件:
- Aggregation_Manuscript_Code.html: HTML格式,研究论文相关的代码文件。
适用场景
- 动物生态学研究: 分析草原鸣禽领地聚集的驱动因素,检验社会互动假说。
- 行为生态学研究: 探究额外配对交配、合作防御等社会行为对繁殖策略的影响。
- 分子生态学研究: 利用基因分型数据研究种群遗传结构与亲缘关系。
- 保护生物学应用: 为草原鸣禽栖息地管理与保护提供科学依据。
- 统计模型验证: 基于巢成功率、领地密度等数据验证生态学模型。