数据集概述
本数据集是关于欧洲青蟹(Carcinus maenas)线粒体基因型对冷应激响应影响的研究数据。内容涵盖冷应激响应表型数据、线粒体CO1基因序列、两个代表性核基因SNP数据,以及相关说明文档,用于验证线粒体或核基因对热耐受性的影响,支持线粒体变异影响 ectotherms 热耐受性的研究结论。
文件详解
- 说明文档(README文件)
- 文件名称:README_for_Nuclear_UBE2H.txt、README_for_Nuclear_SMC.txt、README_for_Dryad_phenotype_genotype_data.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:分别对应核基因UBE2H、核基因SMC、表型基因型数据的说明文档,解释数据来源、用途及关键信息(如Nuclear_SMC.fasta中34位的C/T SNP)。
- 核基因序列文件
- 文件名称:Nuclear_SMC.fasta、Nuclear_UBE2H.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:包含核基因SMC和UBE2H的序列数据,用于代表核遗传谱系的SNP分析,支持热耐受性相关的基因效应研究。
- 表型基因型数据文件
- 文件名称:Dryad_phenotype_genotype_data.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含欧洲青蟹冷应激响应表型数据(如4.5℃下的翻身能力)及对应的线粒体基因型、核基因SNP数据,用于关联分析基因型与表型的关系。
数据来源
论文“Mitochondrial genotype influences the response to cold stress in the European green crab Carcinus maenas”
适用场景
- 海洋生物适应性研究:分析欧洲青蟹线粒体基因型对冷应激响应的影响,探究 ectotherms 热耐受性的分子机制。
- 入侵物种扩散研究:通过线粒体基因型与热耐受性的关联,研究入侵种群的局部适应机制。
- 分子生态学分析:利用线粒体CO1基因和核基因SNP数据,开展物种遗传谱系及适应性进化研究。
- 性别特异性表型分析:研究不同性别青蟹中线粒体单倍型对冷应激响应的差异效应。