数据集概述
本数据集记录玫胸白斑翅雀（Pheucticus ludovicianus）与猩红丽唐纳雀（Piranga olivacea）杂交种的首次自然杂交证据，包含低覆盖度全基因组测序、鸣声分析及自然史推断数据，证实杂交种母本为玫胸白斑翅雀、父本为猩红丽唐纳雀，其基因组杂合度极高，每百碱基对约有一个杂合位点。
文件详解
- 文档文件（Document files）
- 文件名称：README.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：数据集说明文档，包含数据背景、实验方法及文件说明等内容
- 音频文件（Audio files）
- 文件名称：SCTA_countersinging_with_Cardinalidae_hybrid_MMSP_ButlerCo_PA_06112020_TBJ-2030.wav、Cardinalidae_hybrid_SCTAxRBGR_MMSP_ButlerCo_PA_06112020_TBJ-2026.wav、Cardinalidae_hybrid_SCTAxRBGR_MMSP_ButlerCo_PA_06112020_TBJ-2021.wav
- 文件格式：WAV
- 字段映射介绍：杂交种与猩红丽唐纳雀的鸣唱音频，记录自然条件下的鸣声交互
- 标注文件（Annotation files）
- 文件名称：SCTA_countersinging_with_Cardinalidae_hybrid_MMSP_ButlerCo_PA_06112020_TBJ-2030_identity-annotations.Table.1.selections.txt、Cardinalidae_hybrid_SCTAxRBGR_MMSP_ButlerCo_PA_06112020_TBJ-2026.Table.1.selections.txt、Cardinalidae_hybrid_SCTAxRBGR_MMSP_ButlerCo_PA_06112020_TBJ-2021.Table.1.selections.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含Selection（序号）、Channel（通道）、Begin Time（开始时间）、End Time（结束时间）、Low Freq（低频）、High Freq（高频）、Annotation（标注内容）等字段，记录鸣声音频的时间区间、频率范围及物种鸣声交互标注
数据来源
论文“Genetic confirmation of a hybrid between two highly divergent cardinalid species: A Rose-breasted Grosbeak (Pheucticus ludovicianus) and a Scarlet Tanager (Piranga olivacea)”
适用场景
- 鸟类杂交种遗传鉴定: 利用基因组数据验证远缘物种自然杂交的遗传证据
- 鸟类鸣声特征分析: 通过音频及标注文件研究杂交种与亲本的鸣声相似性及交互模式
- 物种进化关系研究: 分析分化超千万年的鸟类物种杂交的基因组杂合度及存活机制
- 生物声学监测应用: 基于鸣声标注数据开发野生杂交鸟类的声学识别模型
