数据集概述
本数据集聚焦仓储螨类Tyrophagus putrescentiae体内Cardinium与Wolbachia两种胞内共生菌的三方互作关系,包含单感染与双感染螨群的基因表达关联数据,通过转录组分析揭示共生菌对宿主基因调控通路的影响及相互作用机制,为研究微生物共生动态提供支持。
文件详解
- 文件名称:Additional_file_3 - Supplementary dataset.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含仓储螨类单感染与双感染样本的转录组数据,涵盖Cardinium与Wolbachia的基因表达相关性、螨类预测KEGG基因表达与共生菌基因表达的关联数据,支持分析共生菌互作及宿主通路调控变化。
数据来源
GenBank(PRJNA493156、PRJNA690683、PRJNA656450、PRJNA990474、PRJNA706095)及基因组数据(JAUEML01、JAUEMM01、JBBPFL01)
适用场景
- 微生物共生互作机制研究: 分析Cardinium与Wolbachia在双感染螨群中的基因表达变化及相互调控关系。
- 宿主-共生菌通路调控分析: 探究共生菌对螨类免疫、代谢通路(如MAPK、内吞作用、钙信号)的影响差异。
- 仓储螨类共生动态研究: 解析单/双感染状态下共生菌对宿主适合度及种群结构的作用机制。
- 微生物生态竞争策略分析: 揭示Cardinium抑制Wolbachia生长的分子机制及共生菌间的竞争策略。