数据集概述
本数据集为论文“SRRM2 splicing factor modulates cell fate in early development”的补充表格，包含十五张表格，涵盖差异表达基因、基因集富集分析（GSEA）、转录因子网络、差异剪接事件、单细胞基因标记等内容，是研究SRRM2剪接因子在早期发育中调控细胞命运的重要补充数据。
文件详解
- 文件名称：Carvalho_supplemental_tables_1-15.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含15张补充表格，具体为：
- Table S1：Srrm2+/-与野生型（WT）胚胎干细胞（ES cells）的差异表达基因
- Table S2：Srrm2+/-细胞中GSEA分析的生物学GO术语
- Table S3：Srrm2+/-细胞中GSEA分析的单细胞胚胎细胞谱系标记物
- Table S4：Srrm2+/-细胞中ORA分析的转录因子
- Table S5：Srrm2+/-细胞中GSEA分析的转录因子网络
- Table S6：Srrm2+/-细胞中显著差异剪接事件
- Table S7：集群2与集群1的差异表达基因
- Table S8：每个集群的单细胞基因标记物
- Table S9：单细胞集群标记物的ORA生物学术语
- Table S10：单细胞集群标记物的ORA表型术语
- Table S11：Srrm2敲低（KD）24小时细胞中显著差异剪接事件
- Table S12：Srrm2敲低（KD）72小时细胞中显著差异剪接事件
- Table S13：Srrm2敲低24小时和72小时重复样本中的转录本异构体表达
- Table S14：Srrm2敲低24小时细胞中的基因表达
- Table S15：Srrm2敲低72小时细胞中的基因表达
数据来源
论文“SRRM2 splicing factor modulates cell fate in early development”
适用场景
- 细胞命运调控机制研究: 分析SRRM2剪接因子对早期发育中细胞命运决定的调控作用。
- 基因表达与剪接分析: 利用差异表达基因和差异剪接事件数据，研究SRRM2对基因表达及剪接的影响。
- 转录因子网络分析: 通过转录因子网络数据，探究SRRM2相关的转录调控机制。
- 单细胞谱系研究: 基于单细胞基因标记物数据，研究胚胎细胞谱系的分化特征。
- 基因功能富集分析: 利用GO术语、表型术语等数据，解析SRRM2调控的生物学过程。
