Cas9_gRNA与Cas12a_gRNA特异性评估补充数据集

数据集概述

本数据集为相关研究论文的补充数据，包含gRNA序列的聚类Logo图及人类HG38参考基因组22号染色体上gRNA的切割效率与方差估算数据，支持对Cas9-gRNA和Cas12a-gRNA特异性的分析。

文件详解

• 文件名称: ClusterLogos.pdf
• 文件格式: PDF
• 内容说明: LOC440792基因中各gRNA聚类的Logo序列图表
• 文件名称: gRNA.xlsx
• 文件格式: Excel
• 内容说明: 包含16个工作表（对应DeepHF和DeepCpf1数据集训练的每个靶标模型），每个工作表字段包括：
• gene - 基因标识符
• position - gRNA靶标的起始位置
• gRNA - gRNA靶标序列
• strand - DNA链方向
• mean - 模型估算的平均切割效率
• variance - 切割效率预测的方差

适用场景

• CRISPR基因编辑工具特异性研究
• gRNA切割效率预测模型验证
• 基因组编辑靶标设计优化分析
• 基因编辑不确定性评估方法研究