数据集概述
本数据集通过转录组分析研究田间种植的四种木薯基因型在季节转换期间的分子适应机制,包含从块根样本制备的3'mRNA-seq文库数据,覆盖雨季至旱季、旱季至雨季的转换过程,验证了数据质量,并通过差异表达和功能富集分析证明其可用性。
文件详解
- 文件名称:GO terms.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含基因本体(GO)术语相关数据,用于功能富集分析
- 文件名称:KEGG pathways.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路相关数据,用于通路富集分析
- 文件名称:Actionable targets.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含可操作目标基因相关数据,用于作物改良策略研究
- 文件名称:Growth parameters.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含木薯生长参数相关数据,用于表型与基因型关联分析
- 文件名称:TF targets.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含转录因子(TF)靶基因相关数据,用于调控机制研究
- 文件名称:Weather data.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含实验期间的气象数据,用于环境因素与基因表达关联分析
- 文件名称:Gene annotations.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含基因注释相关数据,用于基因功能解读
适用场景
- 植物环境适应性研究: 分析木薯在季节转换期间的基因表达变化,探究温度和水分波动下的分子适应机制
- 作物改良策略开发: 基于差异表达分析和功能富集结果,筛选气候适应性品种的候选基因
- 转录调控机制解析: 通过转录因子靶基因数据,研究季节转换中木薯基因表达的调控网络
- 表型与基因型关联分析: 结合生长参数和基因表达数据,揭示环境适应性的遗传基础
- 农业气象与作物响应研究: 利用气象数据和转录组数据,分析环境因素对木薯基因表达的影响