数据集概述
本数据集为牛种群混合时间区分研究的原始数据，包含基于47,506个SNP位点分析1369个个体基因组结构的相关文件。研究通过开发的scaled block size（SBS）指标，区分牛种群近期与古代混合事件，涉及非洲古老混合品种、西班牙起源的新大陆牛及近期杂交种等群体，可用于分析牛种群遗传结构与混合历史。
文件详解
- README_for_RawData_JHered.zip.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：说明数据内容与格式，包括SNP数据格式（[SNPNUMBER, INDIVIDUAL ID, GENOTYPE]）、各文件（ibmc_markers041709.csv、all_ind_info.csv、breedcodes.csv、Xheterozygosity.csv）的用途及基因型编码规则（1=纯合A、2=纯合B、3=杂合、10=缺失数据）。
- RawData_JHered.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包内包含SNP数据文件（按品种代码分类）、标记信息文件、个体信息文件、品种代码文件及X染色体杂合度文件等，用于基因组混合时间分析。
数据来源
论文“A genomic approach for distinguishing between recent and ancient admixture as applied to cattle”
适用场景
- 牛种群遗传结构分析: 利用SNP数据研究牛种群的基因组混合比例与染色体水平的祖先来源。
- 混合事件时间区分: 应用SBS指标区分牛种群近期与古代混合事件，分析不同群体的混合历史差异。
- 性别遗传差异研究: 通过Xheterozygosity.csv文件分析X染色体杂合度，区分个体性别及研究性别相关遗传特征。
- 品种起源与演化研究: 结合个体信息与品种代码，探究牛品种的起源、扩散及杂交演化过程。
