数据集概述
本数据集围绕野生豚鼠（Cavia aperea）父代热暴露的表观遗传跨代响应展开，记录了5只成年雄性豚鼠（F0）经2个月热暴露后，F0代肝脏及F1代肝脏、睾丸组织的DNA甲基化差异，通过简化甲基化测序揭示了可跨代传递的差异甲基化区域及相关基因信息。
文件详解
- F1L_coverage_MethLevels.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：包含F1代野生豚鼠肝脏组织的甲基化覆盖度及甲基化水平数据
- Venn_data_genes_table_F0LF1LF1T_withGO.tsv
- 文件格式：TSV
- 字段映射：包含基因ID（gene_id）、基因名称（gene_name）、GO功能注释（GO IDs）、样本分组（group）、染色体位置（scaff、begin、end）等信息，记录F0代肝脏（F0L）、F1代肝脏（F1L）、F1代睾丸（F1T）的差异甲基化相关基因数据
- F0L_coverage_MethLevels.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：包含F0代野生豚鼠肝脏组织的甲基化覆盖度及甲基化水平数据
- F1T_coverage_MethLevels.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：包含F1代野生豚鼠睾丸组织的甲基化覆盖度及甲基化水平数据
适用场景
- 表观遗传跨代传递研究：分析父代热暴露诱导的DNA甲基化变化在野生豚鼠子代中的传递规律
- 热应激表观遗传机制研究：探究野生豚鼠应对环境温度升高的表观遗传适应机制
- 基因功能注释分析：基于GO IDs注释信息，研究差异甲基化基因的生物学功能及通路
- 野生动物适应性进化研究：结合全球变暖背景，评估表观遗传机制对物种生存的潜在作用
