数据集概述
本数据集为CB1376 daf-3(e1376)X菌株秀丽隐杆线虫的行为实验数据,属于秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分。实验记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养基中的行为,包含视频追踪数据、特征提取数据等,可用于分析线虫的运动行为特征。
文件详解
- 核心行为数据文件
- 文件名称:daf-3 (e1376)X on food R_2010_07_27__11_04_4243.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为的原始追踪数据,包含视频帧对应的线虫运动坐标、时间戳等基础行为信息
- 行为特征数据文件
- 文件名称:daf-3 (e1376)X on food R_2010_07_27__11_04_4243_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储经tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,涵盖运动速度、身体弯曲度等衍生特征
- 压缩行为数据文件
- 文件名称:daf-3 (e1376)X on food R_2010_07_27__11_04_4243.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩格式的线虫行为数据文件,包含标准化的行为记录数据
数据来源
C. elegans behavioural database
适用场景
- 线虫行为表型分析:用于研究daf-3基因变异对线虫运动行为、摄食行为等表型的影响
- 模式生物行为机制研究:结合基因背景分析线虫行为的分子调控机制
- 行为实验方法验证:作为标准化线虫行为实验的参考数据,验证实验方法的重复性
- 线虫行为特征提取算法优化:基于原始追踪数据优化行为特征提取的算法模型