数据集概述
本数据集为评估克拉里昂-克利珀顿断裂带(CCZ)小型底栖桡足类物种多样性的研究数据,包含蛋白质组指纹(MALDI-TOF MS)和DNA条形码两种分子鉴定方法的结果,涉及2000余件标本,旨在为深海采矿背景下的生物多样性监测提供技术参考。
文件详解
- README_file.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:数据集说明文档,包含数据上传至Data Dryad项目的背景、关联论文信息(DOI:10.1007/s12526-022-01307-y)及数据内容概述
- Hellinger_Matrix_1445_specimens.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含1445件标本的Hellinger转换矩阵,字段为带编号的特征列(如X2006.21907693357)
- Hellinger_Matrix_727_specimens.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含727件标本的Hellinger转换矩阵,字段结构同1445标本矩阵
- Hellinger_Matrix_321_specimens.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含321件标本的Hellinger转换矩阵,字段结构同上述矩阵文件
- Raw_Spectra.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:原始质谱数据压缩包,包含MALDI-TOF MS蛋白质组指纹分析的原始光谱文件
- ReferenceTable.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含标本id、ABGD/GMYC物种划分结果(species_abgd、species_gmyc)、年份(year)、站位(station)、采样信息(MUC)等字段
数据来源
Data Dryad平台,关联论文“Evaluating species richness using proteomic fingerprinting and DNA-barcoding – a case study on meiobenthic copepods from the Clarion Clipperton Fracture Zone”(DOI:10.1007/s12526-022-01307-y)
适用场景
- 深海物种多样性评估:对比两种分子鉴定方法的物种划分结果,分析CCZ桡足类物种丰富度及均匀度
- 深海采矿环境监测:为CCZ区域采矿活动对底栖生物多样性的影响提供基线数据
- 分子鉴定技术验证:评估蛋白质组指纹与DNA条形码在深海小型无脊椎动物鉴定中的适用性
- 生物多样性参考库构建:支持CCZ区域桡足类质谱与DNA条形码参考数据库的建立
- 稀有物种分布分析:基于2000余件标本的数据集,研究CCZ桡足类中稀有物种的分布特征