数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了CE1047菌株(基因型egl-30(ep271)I)的行为实验数据。实验由Laura Grundy在William R Schafer实验室完成,使用tierpsy软件追踪分析,包含视频及处理后的行为特征数据,可用于研究该基因突变体的行为表型。
文件详解
- 核心数据文件(Scientific files)
- 文件名称:
egl-30 (ep271gf) on food L_2010_02_26__09_44_30___8___4.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为实验的原始追踪数据,包含19896个分段骨架信息,记录线虫运动的空间坐标及时序变化
- 文件名称:
egl-30 (ep271gf) on food L_2010_02_26__09_44_30___8___4_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,基于原始追踪数据提取的运动参数(如速度、弯曲度等)
- 归档文件(Archive files)
- 文件名称:
egl-30 (ep271gf) on food L_2010_02_26__09_44_30___8___4.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为数据的wcon格式文件压缩包,用于行为数据的标准化存储与交换
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 基因功能研究: 分析egl-30(ep271)基因突变对秀丽隐杆线虫行为表型的影响
- 线虫行为学分析: 基于追踪数据研究线虫在食物环境中的运动模式、速度及形态变化
- 神经生物学机制探索: 结合基因型与行为数据,探究相关信号通路对行为调控的分子机制
- 行为数据分析方法验证: 用于测试或优化线虫行为追踪软件(如tierpsy)的算法性能
- 模式生物表型组学研究: 作为秀丽隐杆线虫行为表型数据库的一部分,支持大规模表型数据整合分析