数据集概述
本数据集包含178份矢车菊标本的ITS1基因分型数据，用于研究欧洲多倍体矢车菊的隐入侵现象。数据通过形态学和ITS1测序两种方式估算样本倍性，并验证两者的一致性，覆盖标本来源、采集信息及地理坐标等元数据，支持矢车菊多倍体分布与入侵机制的分析。
文件详解
- Centaurea_stoebe_ITS1_script.sh
- 文件格式：SH
- 字段映射介绍：包含处理原始序列数据的脚本，使用PEAR v0.9.6、cutadapt v3.2、vsearch v2.28.1软件，输出样本ITS1变异体的读段数量表。
- Centaurea_stoebe_sample_list.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含样本ID、实验室编号、形态学倍性估算（2=二倍体/4=四倍体）、ITS测序倍性估算、形态与基因倍性一致性（1=一致/0=不一致）、原产国、标本馆、标本馆编号、采集者、采集年份、地点、纬度、经度等字段。
- Centaurea_stoebe_ITS1_sequences.fasta
- 文件格式：FASTA
- 字段映射介绍：包含获得的ITS1变异体序列。
- Centaurea_stoebe_ITS1_sequence_numbers.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含OTU（ITS1变异体编号）、size（该变异体的总序列数），以及各样本映射到每个ITS1变异体的读段数量列。
数据来源
论文“Herbarium specimens reveal a cryptic invasion of polyploid Centaurea stoebe in Europe”
适用场景
- 植物隐入侵研究：分析多倍体矢车菊在欧洲的分布扩张模式及入侵机制。
- 倍性鉴定方法验证：对比形态学与ITS1测序两种倍性估算方法的一致性。
- 植物标本馆数据挖掘：利用历史标本信息追溯矢车菊多倍体的时空分布变化。
- 入侵植物生态学分析：结合地理坐标研究矢车菊多倍体的生境偏好与扩散路径。
