数据集概述
本数据集为无 queen 克隆掠夺者蚂蚁 Cerapachys biroi 的基因组相关数据,该蚂蚁是研究昆虫社会分工分子调控的重要模型。数据集包含基因序列、进化树及基因列表等文件,支持对其繁殖方式、社会行为相关基因的分析,共5个文件。
文件详解
- 进化树文件(.tre)
- 文件名称:CYPs_573.tre、UGTs_321.tre
- 文件格式:TRE
- 字段映射介绍:包含细胞色素P450(CYPs)和尿苷二磷酸葡萄糖醛酸转移酶(UGTs)基因家族的进化树结构数据
- 基因序列文件(.fasta)
- 文件名称:CYPs_573.muscle.fasta、UGTs_321.muscle.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:包含CYPs和UGTs基因家族的多序列比对结果,由Muscle工具生成
- 基因列表文件(.xlsx)
- 文件名称:UGT CYP and OR gene lists.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含UGT、CYP及嗅觉受体(OR)基因的列表信息
数据来源
论文“The genome of the clonal raider ant Cerapachys biroi”
适用场景
- 昆虫社会分工分子机制研究: 分析Cerapachys biroi繁殖与育幼交替行为相关的基因动态调控
- 基因家族进化分析: 利用进化树和序列比对数据研究CYPs、UGTs等基因家族的进化关系
- 克隆繁殖机制研究: 结合基因组数据探索其自动混合生殖(automixis)的分子基础
- 社会昆虫模型构建: 基于该无 queen 克隆蚂蚁模型,建立社会行为与基因型关联的研究体系