数据集概述
本数据集是鲸偶蹄目哺乳动物水生过渡分子适应系统发育基因组学分析的相关数据,包含鲸类与河马等物种的转录组及基因组数据,构建了含23种哺乳动物的6845个编码DNA序列的系统发育基因组数据集,用于探究鲸类分子适应的发生时间与功能特征。
文件详解
- 文件名称:
Tsagkogeorga_et_al_alignments.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内含鲸偶蹄目哺乳动物水生过渡分子适应分析相关的序列比对数据,涉及11000余个直系同源基因、23种哺乳动物的6845个编码DNA序列等系统发育基因组分析所需的核心数据,具体字段需解压后查看原始序列文件。
数据来源
论文“A phylogenomic analysis of the role and timing of molecular adaptation in the aquatic transition of cetartiodactyl mammals”
适用场景
- 分子演化研究:分析鲸类与河马在水生适应过程中的分子适应事件发生时间与选择压力差异。
- 功能基因组学分析:探究脂代谢、缺氧适应、肌肉与脑功能相关基因在鲸类水生过渡中的适应性演化。
- 系统发育基因组学研究:利用大规模直系同源基因数据集构建鲸偶蹄目物种的系统发育关系。
- 蛋白质互作网络分析:研究鲸类神经与肌肉系统相关基因产物的聚类特征及功能关联。