数据集概述
本数据集为鸟类疟疾样寄生虫Leucocytozoon的媒介亲子传播研究相关数据,包含基因分型、微卫星序列、巢雏表、coxIII基因序列、基因型文件及分析代码等6个文件,支持验证宿主亲缘关系与寄生虫遗传相似性的关联,为媒介介导的准垂直传播机制研究提供数据基础。
文件详解
- Genotypes used by Chakarov et al. Apparent mother to offspring transmission.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含样本名称(Sample.Name)、标记(Marker)及10个等位基因(Allele.1至Allele.10)等字段,记录寄生虫基因型数据。
- Dataset of Chakarov et al. vector-mediated parent-to-offspring transmission.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含配对编号(Dyad nr)、雏鸟标识(chick1、chick2)、遗传距离(Genetic distance)、母本标识、母本羽色形态一致性、父本羽色形态一致性等字段。
- Leucocytozoon buteonis microsatellites with flanking sequences.fasta
- 文件格式:FASTA
- 内容介绍:Leucocytozoon buteonis微卫星序列及侧翼序列数据。
- Nestling table used by Chakarov et al apparent vector mediated parent to offspring transmission.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 内容介绍:巢雏相关信息表格,支持亲子传播研究的样本背景分析。
- Lbuteonis coxIII as entered in Genbank KP640617.fasta
- 文件格式:FASTA
- 内容介绍:GenBank登录号KP640617对应的Leucocytozoon buteonis细胞色素c氧化酶亚基III(coxIII)基因序列。
- code_Chakarovetal_Apparent_mother_to offspring_transmission_of_Leucocytozoon.R
- 文件格式:R
- 内容介绍:用于分析Leucocytozoon母本至子代传播的R语言代码。
数据来源
论文“Apparent vector-mediated parent-to-offspring transmission in an avian malaria-like parasite”
适用场景
- 寄生虫传播机制研究:分析媒介介导的Leucocytozoon亲子传播模式及遗传相似性关联。
- 宿主-寄生虫共进化分析:探究宿主亲缘关系对寄生虫交换的影响,支持共进化及毒力演化研究。
- 分子寄生虫学研究:利用微卫星序列、coxIII基因序列开展Leucocytozoon的分子特征分析。
- 鸟类寄生虫流行病学研究:结合巢雏表数据,分析野生猛禽种群中Leucocytozoon的传播规律。