数据集概述
本数据集包含长舌蝠（Glossophaginae）的超保守元件（UCE）基因组数据，支持形态学与遗传学研究，验证Anoura carishina与Anoura latidens的同义关系。数据以多目录结构存储，涵盖原始UCE位点序列及经MAFFT对齐、修剪的处理后序列文件。
文件详解
该数据集由多个目录和文件组成，具体说明如下：
- 核心目录:
- zyh585nh8d-1/: 主目录，包含所有子目录和文件
- zyh585nh8d-1/UCE loci/: 存储原始UCE位点序列文件
- 文件示例: uce-42.nexus、uce-1268.nexus等，共七百三十一个编号文件
- 文件格式: .nexus
- zyh585nh8d-1/Aligned UCE sequences/: 存储对齐后的UCE序列文件
- mafft-nexus-edge-trimmed-clean-100p-nexus/目录: 包含对齐修剪后的nexus格式文件，如mafft-nexus-edge-trimmed-clean-100p.nexus
- mafft-nexus-edge-trimmed-clean-100p-raxml/目录: 包含RAxML分析相关文件，如mafft-nexus-edge-trimmed-clean-100p.phylip（序列文件）、mafft-nexus-edge-trimmed-clean-100p.charsets（字符集文件）
- 文件类型分布:
- .nexus: 七百四十二个文件（占比约百分之九十九点七三）
- .phylip: 一个文件（占比约百分之零点一三）
- .charsets: 一个文件（占比约百分之零点一三）
数据来源
Calderón-Acevedo, C. A., Rodríguez-Posada, M. E., & Muchhala, N.（2021）发表于Mammalia期刊的研究论文
适用场景
- 蝙蝠分类学研究: 验证Anoura属物种的分类地位
- 基因组进化分析: 分析长舌蝠超保守元件的序列特征与进化模式
- 系统发育研究: 基于UCE数据构建长舌蝠的系统发育树
- 生物信息学方法验证: 测试MAFFT对齐、RAxML分析等生物信息学工具的应用效果
