数据集概述
该数据集包含聚焦文库CRISPR筛选质量分析及MAGOHB基因敲除后ARHGAP融合类器官中异常剪接事件的相关数据，支撑对胃癌代谢脆弱性的研究，涉及CRISPR筛选、生长竞争实验、RNA-seq及剪接分析等内容。
文件详解
- 文件名称: A combined enteric neuron-gastric tumor organoid r/Data S1.docx
- 文件格式: DOCX (.docx)
- 内容涵盖:
- CRISPR筛选质量评估（sgRNA检测分布、生物学重复 reproducibility）
- MAGOHB敲除对ARHGAP融合/非融合类器官的生长竞争影响
- 类器官GFP干扰率与倍增频率的关联分析
- RNA-seq揭示的异常剪接事件（含A3SS、A5SS等类型及CTNND1-ARHGAP26融合基因剪接变化）
- 融合基因片段丰度及蛋白表达变化数据
- 差异剪接基因及下调基因的通路富集分析（Hallmark基因集）
适用场景
- 胃癌代谢脆弱性机制研究
- CRISPR筛选技术在肿瘤类器官中的应用评估
- 异常RNA剪接与肿瘤发生发展的关联分析
- 肿瘤融合基因功能及调控机制研究
- 肿瘤靶向治疗潜在靶点（如MAGOHB）的验证与机制探索
