肠炎沙门氏菌WbaP结构关联数据集

数据集概述

本数据集包含肠炎沙门氏菌WbaP蛋白的结构关联数据,涵盖XLMS交联数据、CDMS数据、AlphaFold生成的二聚体模型及Foldseek分析结果,为该蛋白结构研究提供多维度数据支持。

文件详解

  • 主目录文件:
  • S_enterica_WbaP_foldseek_afdb-proteome.m8:m8格式文件,为WbaP蛋白与AlphaFold蛋白质组数据库的Foldseek分析输出结果
  • S_enterica_WbaP_full_dimer_AlphaFold.pdb:pdb格式文件,为AlphaFold生成的WbaP蛋白二聚体模型
  • XLMS目录文件(位于XLMS/目录下):
  • S_enterica_WbaP_tBuPhoX_in solution-3DixTm.xlsx:xlsx格式文件,为使用tBu-PhoX交联剂的WbaP蛋白XLMS交联数据
  • S_enterica_WbaP_DSS_in solution-vn6EzO.xlsx:xlsx格式文件,为使用DSS交联剂的WbaP蛋白XLMS交联数据

适用场景

  • 蛋白质结构生物学研究:解析肠炎沙门氏菌WbaP蛋白的空间构象及二聚体形成机制
  • 交联质谱数据分析:验证WbaP蛋白的XLMS交联结果与结构模型的一致性
  • 蛋白质组学比对研究:基于Foldseek分析结果探究WbaP蛋白与其他同源蛋白的结构相似性
  • 计算结构生物学应用:评估AlphaFold模型在膜蛋白结构预测中的准确性
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.68 MiB
最后更新 2025年11月28日
创建于 2025年11月27日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。