数据集概述
本数据集聚焦大肠杆菌蛋白质折叠过程中分子伴侣的作用，通过有限蛋白水解质谱（LiP-MS）分析，比较了体内初级生物发生与体外复性时蛋白质对分子伴侣的依赖性差异，探讨了触发因子和DnaKJ缺失对蛋白质结构的影响，揭示了部分蛋白质的共翻译折叠特性。
文件详解
- 蛋白结构变化分析文件（TSV格式）
- 文件名称：20240826_WT_30_LiP_v_DeltaTig_30_LiP_Cut_Site.tsv、20240826_WT_30_LiP_v_DeltaDnaK_30_LiP_Cut_Site.tsv、20240826_WT_37_LiP_v_DeltaTig_37_LiP_Cut_Site.tsv、20240826_WT_37_LiP_v_DeltaDnaK_37_LiP_Cut_Site.tsv
- 文件格式：TSV
- 字段映射介绍：包含Protein ID（蛋白质ID）、Cut Site ID（切割位点ID）、Gene Entry Name（基因条目名称）、P-value（P值）、Adj. P-value（校正P值）、Normalized FC（标准化倍数变化）、Log2 Normalized FC（对数2标准化倍数变化）等，记录LiP-MS检测的蛋白质结构变化数据。
- 分子伴侣辅助复性分析文件（XLSX格式）
- 文件名称：GroEL Native_v_GroEL Refolding 5min CutSite Summary.xlsx、DnaKJ Native_v_DnaKJ Refolding 5min CutSite Summary.xlsx、Cytoserum Native_v_Cytoserum Refolding 5min CutSite Summary.xlsx、GroEL Native_v_GroEL Refolding 5min Protein Summary.xlsx、DnaKJ Native_v_DnaKJ Refolding 5min Protein Summary.xlsx、Cytoserum Native_v_Cytoserum Refolding 5min Protein Summary.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含蛋白质在GroEL、DnaKJ、Cytoserum等分子伴侣辅助下复性的切割位点和蛋白质水平的汇总数据，记录复性过程中的结构变化。
适用场景
- 分子伴侣功能研究: 分析触发因子和DnaKJ在大肠杆菌蛋白质折叠中的作用，比较体内外依赖性差异。
- 蛋白质折叠机制分析: 通过LiP-MS数据探讨蛋白质共翻译折叠特性及分子伴侣的影响。
- 生物发生与体外复性对比研究: 对比蛋白质在体内初级生物发生与体外复性过程中的结构变化差异。
- 大肠杆菌蛋白质组学分析: 利用TSV文件中的蛋白质ID、基因信息等数据开展大肠杆菌蛋白质组的结构与功能研究。
