数据集概述
本数据集支持对分布于印马和古北生态区的叉舌蛙科3个属（Fejervarya、Hoplobatrachus、Quasipaa）的综合物种定界研究，包含多基因座、基因组SNP超矩阵及开放源基因组位点数据，辅以生态位模型和鸣叫录音，用于识别隐存支系并验证分类学分歧。
文件详解
- 物种分布范围文件（位于Species distribution ranges shp/目录）：
- 各物种子目录（如Fejervarya limnocharis/）含ReadMe.txt说明文件及IUCN红色名录分布地图元数据PDF
- 包含SHP、DBF、SHX等GIS矢量文件，记录物种地理分布多边形数据
- 系统发育分析文件：
- Conventional Bayesian tree & partition finder concatenated nuclear/目录：含NEX格式串联核基因数据及RAxML分析结果文件
- Conventional Bayesian tree & partition finder concatenated mtDNA/目录：含串联线粒体DNA数据及贝叶斯分析输出文件
- 鸣叫分歧分析文件（位于Call divergence for Yangtze Basin cryptic clades/目录）：
- CSV格式鸣叫特征数据文件（如Call_extraction_revised6Ind.csv），含物种、体型、鸣叫时长等字段
- PNG格式统计分析图表（如温度校正鸣叫时长ANOVA图）及R语言分析脚本
- 贝叶斯物种定界模型文件（位于18 comparative Bayesian species delimitation models (multilocus)/目录）：
- XML格式控制文件及NEX格式输入数据，对应18种竞争拓扑假设分析
- 基因组SNP数据文件：
- Supermatrix concatenated SNPs + Model A1/目录含VCF格式SNP位点数据及分析结果图片
适用场景
- 两栖动物分类学研究：修正GenBank错误记录，解析Fejervarya属物种复合体的隐存分歧
- 进化生物学分析：验证贝叶斯物种定界模型，探究生态因子对物种分布的影响
- 生物声学研究：分析长江流域隐存支系的鸣叫特征差异及温度校正方法
- 生物多样性保护：基于生态位模型识别关键环境变量，支持叉舌蛙科物种保护规划
- 基因组学方法优化：复用开放源GBS、RNA-seq等基因组数据的整合分析框架
