数据集概述
本数据集聚焦新热带区共生蚂蚁Crematogaster levior与Camponotus femoratus的隐种分化研究,包含两类蚂蚁的表皮碳氢化合物(CHC)数据、基因型序列、形态测量数据及环境关联分析材料,共18个文件,用于探究CHC在隐种分化中的作用及生态位分化特征。
文件详解
- 基因型序列文件(共11个.fasta文件)
- 文件名称:如Clev_Alignment_COI.fasta、Cfem_Alignment_ant1087.fasta等
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:包含两类蚂蚁不同基因片段(如COI、ant1087)的序列比对数据,用于种群遗传学分析
- 化学数据文件
- 文件名称:Chemical data from Hartke, Sprenger et al. 2019.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录两类蚂蚁的表皮碳氢化合物(CHC)组成及含量数据
- 形态测量数据文件(共2个.csv文件)
- 文件名称:Crematogaster_morphometry_measurements.csv、Camponotus_morphometry_measurements.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含物种、标本编号、化学型、采集地等基础信息,及eye.h(眼高)、mes.l(中胸长)、sca.l(触角柄节长)等形态特征测量数据
- 分析脚本文件(共3个.R文件)
- 文件名称:Crematogaster_morphometry_script.R、_Morphometrics_functions.R、Camponotus_morphometry_script.R
- 文件格式:R
- 字段映射介绍:形态测量数据的分析脚本及函数库
- 形态特征定义文件
- 文件名称:Definitions of Morphologial Traits.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:形态测量指标的详细定义说明
数据来源
论文“Cuticular hydrocarbons as potential mediators of cryptic species divergence in a mutualistic ant association”
适用场景
- 昆虫隐种分化机制研究:通过CHC数据与基因型、形态数据的关联分析,探究CHC在隐种分化中的作用
- 共生体生态位分化分析:结合环境变量数据,评估隐种对气候、植被等生态位的偏好差异
- 昆虫化学通讯研究:分析CHC作为信息素在蚂蚁种内识别及生殖隔离中的功能
- 生物多样性监测:利用基因型与形态数据的整合,建立隐种鉴定的标准化方法
- 进化生物学研究:探讨共生关系驱动物种分化的分子与生态机制