ChEBI中肽定义的补充数据集

数据集概述

本数据集是论文《Defining Peptides in ChEBI》的补充数据,包含肽本体修订文件、一阶逻辑定义文件、PubChem和ChEBI分子分类结果、人工评估表格及专家调查问卷等8个文件,为肽类化合物的定义与分类研究提供支撑。

文件详解

  • Additional File 1: chemlog.omn,格式为OWL Manchester Syntax,内容为修订后的肽本体
  • Additional File 2: substructures_fol.tptp,格式为TPTP Syntax,内容为2,5-二酮哌嗪和埃默里酰胺的一阶逻辑(FOL)定义
  • Additional File 3: proteinogenics_fol.tptp,格式为TPTP Syntax,内容为蛋白质氨基酸残基的一阶逻辑(FOL)定义
  • Additional File 4: pubchem_classification_results.zip,格式为ZIP压缩包,内容为PubChem分子分类结果(JSON格式)
  • Additional File 5: chebi_classification_results.json,格式为JSON,内容为ChEBI分子分类结果
  • Additional File 6: chebi_3_star_molecules_manual_eval.ods,格式为OpenDocument Spreadsheet,内容为ChEBI未被自动分类为阳性的分子人工评估结果
  • Additional File 7: questionnaire_peptide_classification.odt,格式为OpenDocument Text,内容为专家调查所用问卷
  • Additional File 8: questionnaire_peptide_classification.pdf,格式为PDF,内容为专家调查所用问卷

适用场景

  • 生物化学研究:用于肽类化合物的本体构建与定义研究
  • 计算化学分析:支撑分子分类算法的开发与验证
  • 数据库优化:辅助ChEBI等生物分子数据库的肽类化合物分类体系完善
  • 专家共识研究:为肽类分类标准的专家调查与共识形成提供工具支持
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 591.06 MiB
最后更新 2025年12月7日
创建于 2025年12月7日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。